Sebanyak 11 Sekolah Dasar Negeri (SDN) di Kota Mojokerto kekurangan pagu. Salah satunya SDN Mentikan 6 yang hanya mendapatkan 10 pendaftar hingga ditutupnya jalur zonasi PPDB.
Sistem pendaftaran Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB) secara online di Kota Mojokerto telah dibuka sejak 29 Juni 2020. Dalam kurun waktu dua hari, kuota bagi calon peserta didik di Kota Mojokerto telah mencapai 70 persen.